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ISH-武漢思特進

根據不同的雜交實驗要求,應選擇不同的核酸探針。在大多數情況下,可以選擇克0隆的dna或cdna雙鏈探針。但是在有些情況下,必須選用其它類型的探針如寡核苷酸探針和rna探針。例如,在檢測靶序列上的單個堿基改變時應選用寡核苷酸探針,在檢測單鏈靶序列時應選用與其互補的dna單鏈探針(通過克0隆人m13噬菌體dna獲得)或rna探針,ish,寡核苷酸探針也可。長的雙鏈dna探針特異性較強,適宜檢測復雜的靶核苷酸序列和病原體 ,但不適宜于組織原位雜交,因為它不易透過細胞膜進入胞內或核內。在這種情況下,寡核苷酸探針和短的pcr標記探針(80~150bp)具有較大的優(yōu)越性。
雜交液中的陽離子濃度通過靜電排斥作用影響了雜交體之間的鏈穩(wěn)定性,較高的鹽濃度將增加雜交體的穩(wěn)定性。大于0.4m的na離子濃度,對tm值、雙鏈復性速率的影響不大,但隨著na離子濃度的降低,將顯著影響tm值和雙鏈復性速率。
有2機溶2劑(甲酰胺)的作用是降低dna-dna和dna-rna等雙鏈體的解鏈溫度。通常dna需要在0.1~0.2m na 90~100℃的條件下變性,那么應用于原位雜交,樣品必須在65~75℃的條件下進行長時間變性,這將導致樣品形態(tài)學的*。50%甲酰胺的應用能將雜交溫度降至30~45℃。
*葡聚糖具有很強的水合性,高濃度的*葡聚糖會使得核酸分子無法獲得周邊親水環(huán)境,增加了探針濃度,加快雜交反應速率。
原位雜交是指;分子雜交的一種形式。由未經抽提分離的染色體dna,在原來位置上被變性成單鏈后,與探針進行分子雜交。1977年由本頓(w.d.be*n)和戴維斯(r.w.d*is)在原分子雜交基礎上發(fā)展的一種較新的分子雜交技術。方法是將菌落或噬菌斑轉移到硝9酸纖維素濾膜上,使在原位發(fā)生溶菌后變性的dna,同濾膜原位結合,再與有放5射性同位素標記的特定核苷酸“探針”雜交,其結果可用放5射自顯影來顯示,出現銀粒的地方便是待測染色體dna上與探針互補順序所在的位置。對快速檢測轉化群落中的dna序列或任何一種插入的dna序列,以及動植物的*定位工作,都具有廣泛應用價值。(見“分子雜交”、“放5射自顯影”、“影印培養(yǎng)技術”)
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